院系專業(yè)
根據(jù)2014年9月學校官網顯示，學校本部設有中醫(yī)臨床學院、藥學院、針灸推拿學院、中西醫(yī)結合學院、臨床醫(yī)學院、護理學院、基礎醫(yī)學院、公共衛(wèi)生學院、醫(yī)學技術學院、信息工程學院、經貿與管理學院、人文與社會科學學院、繼續(xù)教育學院、藏醫(yī)學院、附屬醫(yī)院臨床教學部、理科教學部、外語教學部、體育藝術課部等18個教學院（部），另有甘肅中醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院、甘肅中醫(yī)學院附屬醫(yī)院2個附屬醫(yī)院，有20個本科專業(yè)。
專業(yè)設置
公共衛(wèi)生學院 預防醫(yī)學（五年制本科）
信息工程學院 醫(yī)學信息工程（四年制本科）
人文與社會科學學院 應用心理學（醫(yī)學心理學方向、四年制本科）
醫(yī)學技術學院 醫(yī)學影像學（五年制本科）、醫(yī)學檢驗技術（四年制本科）
藏醫(yī)學院 藏醫(yī)學（五年制本科）、藏藥學（四年制本科）
經貿與管理學院 公共事業(yè)管理（醫(yī)藥衛(wèi)生方向、四年制本科）、國際經濟與貿易（中醫(yī)藥方向、四年制本科）
護理學院 護理學（四年制本科）
藥學院 中藥學（四年制本科）、藥物制劑（四年制本科）、中草藥栽培與鑒定（四年制本科）、中藥資源與開發(fā)（四年制本科）
針灸推拿學院 針灸推拿學（五年制本科）、康復治療學（四年制本科）
中西醫(yī)結合學院 中西醫(yī)臨床醫(yī)學（五年制本科）
臨床醫(yī)學院 臨床醫(yī)學（五年制本科）
中醫(yī)臨床學院 中醫(yī)學（五年制本科）、中醫(yī)學（骨傷科學方向、五年制本科
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